Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med17Q8VCD5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms