Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms