Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERC1Q8IUD2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms