Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap29Q8CGF1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap29Q8CGF1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms