Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms