Protein–RNA interactions for Protein: Q6IAA8

LAMTOR1, Ragulator complex protein LAMTOR1, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR1Q6IAA8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMTOR1Q6IAA8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMTOR1Q6IAA8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR1Q6IAA8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms