Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CcncQ62447 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CcncQ62447 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CcncQ62447 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms