Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms