Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms