Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm2P58774 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms