Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms