Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms