Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJA4P35212 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJA4P35212 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJA4P35212 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJA4P35212 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms