Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms