Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4871D3Z0W7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4871D3Z0W7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms