Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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