Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms