Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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