Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms