Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
C4orf17Q53FE4 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms