Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL24A1Q17RW2 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms