Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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GEN1Q17RS7 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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GEN1Q17RS7 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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GEN1Q17RS7 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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