Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP6Q16828 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms