Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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