Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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