Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms