Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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