Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALX1Q15699 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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