Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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SYCP1Q15431 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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SYCP1Q15431 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SYCP1Q15431 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SYCP1Q15431 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SYCP1Q15431 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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