Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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PTPRRQ15256 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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PTPRRQ15256 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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