Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms