Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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