Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SSPNQ14714 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms