Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A3Q14050 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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COL9A3Q14050 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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COL9A3Q14050 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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COL9A3Q14050 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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COL9A3Q14050 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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