Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CNGB1Q14028 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms