Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PDE7AQ13946 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PDE7AQ13946 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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