Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms