Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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