Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOFQ13790 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
APOFQ13790 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
APOFQ13790 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
APOFQ13790 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
APOFQ13790 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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