Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CUL1Q13616 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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CUL1Q13616 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CUL1Q13616 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CUL1Q13616 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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CUL1Q13616 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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CUL1Q13616 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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CUL1Q13616 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL1Q13616 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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CUL1Q13616 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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