Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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