Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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