Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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