Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATMQ13315 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATMQ13315 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ATMQ13315 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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