Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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