Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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