Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SRSF5Q13243 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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