Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
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