Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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