Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IFT88Q13099 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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IFT88Q13099 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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IFT88Q13099 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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